La CTJEBU est une organisation engagée dans l'incubation et la pré-accélération des jeunes entrepreneurs, qu'elle place au cœur de sa mission. Elle leur offre un environnement propice à l'innovation, à travers la formation, le coaching et le mentorat, afin de soutenir la croissance et la structuration de leurs projets. À travers des actions de renforcement des capacités, elle contribue également à l'amélioration de l'environnement des affaires et à la dynamisation du secteur privé.

Par ailleurs, la CTJEBU promeut activement l'esprit d'initiative et l'entrepreneuriat des jeunes Burundais. Elle accorde une attention particulière à l'entrepreneuriat vert et à l'accompagnement des coopératives de jeunes engagés dans l'agroécologie, favorisant ainsi un développement économique inclusif, durable et solidaire.

Aujourd'hui, la CTJEBU se positionne comme une voix structurée et reconnue des jeunes agripreneurs agroécologiques au Burundi, jouant un rôle de catalyseur dans la transition vers une agroécologie inclusive, en mettant au centre de son action les jeunes, les femmes et les groupes vulnérables.